近日，理学院应用物理系孙婷婷教授团队在RNA共转录折叠动力学的研究方面取得重要进展。在《International Journal of Biological Macromolecules》（IF=8.023，中科院一区TOP）期刊上发表了题为“Effect of pausing on the cotranscriptional folding kinetics of RNAs”的研究论文（https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2022.09.115）。浙江科技学院为第一署名单位，应用物理系21级硕士研究生王康为第一作者，孙婷婷教授为论文通讯作者。
该工作揭示了停顿事件与转录速度相互作用对RNA共转录折叠动力学控制的策略，给出了E.coliSRP RNA和HIV-1 TAR RNA的主要折叠路径，以及预测了HIV-1 TAR RNA可能存在的停顿点。通过研究发现，不同的RNA在共转录折叠时对转录速度有不同的偏好。例如117-nucleotideE.coliSRP RNA在较高的转录速度下不利于Native structure结构的形成，但通过转录停顿事件，能挽救Native structure结构的形成。结果表明：停顿事件与转录速度形成互补事件，共同促进RNA共转录折叠，以保证RNA转录折叠为正确的RNA结构，促进生物细胞完成其正常的生理功能。该工作为RNA共转录折叠动力学提供了一套理论基础，同时揭示了停顿对RNA共转录折叠的重要影响。（应用物理系：黄 喆；学科办公室：康 明）
A.coliSRP RNA折叠路径HIV-1 TAR RNA折叠路径
E.coliSRP RNA折叠过程结构的Population
